當然，這里的安全設置教程對Windows Server 2003同樣有效，只是部分步驟有所不同，僅供參考。
其實，不管是windows服務器系統，還是linux服務器系統，只要設置好安全策略，都能最大程度上地保證服務器安全，說不上用linux一定比windows安全，關鍵是看你怎么用，怎么設置安全策略，怎么避免漏洞被利用;windows服務器系統要保證安全，關鍵是要避免這個系統的漏洞被利用。下面是具體的安全配置基礎教程，僅供參考，按個人喜歡而設置：
修改管理員賬號及密碼
windows 2008服務器系統通過遠程登陸來管理的，默認管理員賬號是administactor;如果對方知道你的賬號，可能通過暴力解密獲取你的密碼;所以，要及時修改管理員賬號。
修改流程是：選擇“單擊“開始→運行”，在彈出的運行對話框中輸入“gpedit.msc”打開組策略編輯器，依次展開“設置→→本地策略→安全選項”，并將右邊列表框下拉到最底下，雙擊“重命名系統管理員賬戶”即可更名;修改賬號名稱以后，還要記得修改密碼，建議不低于18位的密碼，必用英文大小寫數字的組合。
修改遠程登陸的端口號
windows系統默認的遠程登陸端口號是3389，這個端口號很容易被掃描到，建議修改成較大的端口號，好比23429，注意別和已知的端口號沖突，如果已開啟防火墻，要關閉3389端口，同時打開23429端口號。
修改端口號的流程是：打開“開始→運行”，輸入“regedit”，打開注冊表，進入以下路徑：[HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEMCurrentControlSetControlTerminal ServerWdsrdpwdTdstcp]，看見PortNamber值，其默認值是3389，修改成所希望的端口即可，例如23429;再打開[HKEY_LOCAL_MACHINESYSTEMCurrentContro1SetControlTenninal ServerWinStationsRDPTcp]，將PortNumber的值(默認是3389)修改成端口23429，以后登陸的時候輸入計算機名IP：23429。
設置防火墻關閉無用端口
windows 2008服務器系統是自帶防火墻的，防火墻可以設置端口號開閉，上面修改過遠程登陸端口號，要記得關閉3389端口，同時增加新設置的端口號;同時建議用端口掃描工具掃描一下，一般服務器只用開啟三個端口，一個是80端口，一個是你的遠程登陸端口，一個是FTP端口。
開啟防火墻以后，默認是禁止PING的，如果希望服務器支持PING，那么在防火墻設置中刪除相應的禁止規則。另外，防火墻不是默認禁止所有非網絡服務端口的，因此建議大家手動禁止必須要用以外的端口。
去掉FTP及數據庫在線管理
因為windows 2008服務器有圖形化界面，因此可用網盤實現網站的備份，遠程登陸后備份網站，上傳到網盤，再從本地電腦從網盤下載網站內容，這樣便可以不啟用FTP;多開啟一個端口便意味著多一分風險，既然windows 2008服務器系統有圖形化界面，那么便應該好好利用這一點。
至于數據庫在線管理，新手都習慣用phpmyadmin來管理，Linux系統的主機通過IP/some space/的方式管理數據庫，這樣實際上是不安全的，相當于多一個安全隱患;對于windows 2008系統的用戶而言，實際上可以遠程登陸后管理數據庫，好比我的網站www.121h.com，原創登陸以后，用IE瀏覽器訪問127.0.0.7即是我的數據庫管理地址，別的用戶無法直接訪問到數據庫管理后臺。
設置好文件權限及補丁更新
如果是用windows系統的服務器建站，那么一定要設置好文件權限，好比禁止腳本運行什么的，設置好以后，那么網站程序本身的安全性會提高不少;另外，要記得及時更新程序及系統補丁，同時增加錯誤登陸設置，用戶通過遠程來登陸系統，輸錯密碼三次，可以禁止30分鐘或者一天什么的。
前段時間，mysql/php接連爆出相應的漏洞，大家同樣要記得升級這些程序的版本，好比現在虛擬主機Php版本是5.2.17，這是比較老的穩定版本，存在hash沖突漏洞，可以升級到5.3.*或者5.4.*;至于mysql，同樣可以升級到5.5.*版本，直接去官網下載相應的程序升級即可，升級前請確認網站程序支持新版本的軟件。
修改在IDC官網的賬號信息
不管你是購買的什么系統的服務器，都應該保證自己在IDC官網的賬號信息安全，這里的賬號、密碼都應該與平時注冊的賬號密碼不同，避免自己一個賬號失竊，被別人利用到這里。另外，部分IDC還有自己的論壇，雖然去論壇交流可以獲得外鏈，不過注意要保證自己的信息安全，不要透露自己的賬號習慣。
以上是個人維護Windows Server 2008服務器的經驗，算是基礎的安全配置教程，能夠防范大部分的漏洞攻擊;當然，如果內存允許，還可以安裝服務器殺毒軟件，同時增加別的防范設置，不過，對于VPS或者云主機用戶而言，殺毒軟件不是必須的，上層設置中有這些，再安裝殺毒軟件可能會沖突。