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走進“太乙” 南科大攜手英特爾跑出“深圳速度”

自2012年4月建校至今,南方科技大學(簡稱南科大)僅用七年時間就取得了泰晤士報全球大學排名第八位(中國內地)的佳績,在高校學術界跑出了前所未有的“深圳速度”。這一系列成果的背后,既有國家持續多年的巨大投入與扶持,也有南科大秉承“敢闖敢試、求真務實、改革創新、追求卓越”的創校精神,在科學研究、技術探索等方面的不斷努力。

截至2018年底,南科大累計發表學術論文5406篇(其中,中期刊論文4618篇、會議論文692篇、學術論著96本),授權專利192項。科研獎勵方面,共計獲得國家級科技獎勵3個,省部級科技獎勵4個,深圳市科技獎勵6個,同時獲得了包括“戈登貝爾獎”、“求實獎”在內的多個國內外獎項。2018年,南科大自然指數加權論文值為83.33,在中國大學自然指數排行榜中排名第28位,化學、材料科學兩個學科也進入了ESI全球前1%。

對于力學、物理學、生物學、化學、材料學等學科來說,用于模擬環境、前沿應用等方面的計算需求與日俱增,傳統的基礎設施并不能支撐新興的科研需求。“我在2015年來到南科大時就做了第一期的超算系統,大約在2017年7月啟動了二期工程。”南方科技大學副校長魯春回憶稱,“我們的教授大概有80%是從國外招回來的,他們要進行科研,對計算資源的需求量在不斷增長,包括我們的學生、博士后,對計算的要求都比較高。”

如今,南科大獲批建設的各級各類科研平臺達到36個,包括省部級科研平臺9個,市級科研平臺27個,另有在建科研機構4個,教授規模增至近400名。為了讓科研工作能夠順利開展,南科大在設備層面提供了強有力的支持,一個顯著的例子就是將一期300個節點的HPC集群進行了大規模升級。2018年11月公布的TOP500中,來自南科大的二期HPC系統——“太乙(TaiYi)”位列第127位,是中國唯一上榜的高校級高性能集群,也是除了國防領域特殊需求的機器之外,計算力能力最高的HPC集群。

南科大二期HPC系統——“太乙(TaiYi)”

據了解,南科大在選擇HPC部署的時候主要考量了兩大因素,一個是教授需求,一方面體現在分析數據時對計算性能、速度的要求,另一方面則是在進行人工智能自動駕駛等算法優化時,系統是否有相關的功能支持。另一個是學科需求,這也是源于南科大在購買系統前對學校各院系的意見征集,例如材料系在分子、原子、電子量級的計算中,對計算量的要求是非常巨大的;計算機系更關注人工智能,要從研究AI的角度看系統是否能滿足要求;生物系并不要求計算有多快,而是要求存儲很快,當存儲的量很大時,能在短時間內把目標找出來。

“學校要買這么一個(HPC)平臺,就要兼顧到所有的需要,所以我們把教授的意見綜合在一起,在我們的招標文件能夠把這些都滿足。資金的來源是由政府提供,我們必須嚴格按照政府資金使用程序來使用。對于誰來應標,最終選擇誰,必須要做到公平公正招標有相應的規則,我們是嚴格按照這個規程走的,并且是在深圳市的采購中心——全市的資金平臺。”魯春說。

最終,南科大選擇了以英特爾至強可擴展Gold 6148 20C 2.4GHz為處理器平臺構建的HPC系統,部署規模為815個雙路刀片節點(每個節點40個核),包括4個GPU節點、2個FPGA節點、4個KNM節點,DSS-G存儲容量5.5PB,云服務器,專門為數據庫搜索等場景設計的胖節點內存為6TB,高速網絡互聯方面則是Omni-Path架構。根據TOP500給出的信息,“太乙”系統的理論峰值性能達到2488.32TFlop/s,實測計算性能達到1686.54 TFlop/s,實測Linpack效率超過67%。能耗方面,采用風冷散熱技術的“太乙”系統PUE在1.5左右,未來也會考慮選用水冷的方案

“太乙(TaiYi)”在TOP500中位列第127位

魯春談到,南科大一直在根據不斷變化的使用需求在調整機器的升級策略,其中不僅包括英特爾、集成商等在硬件、技術領域的更新,還會涉及在人工智能、大數據等使用場景的應用。例如多采用螺旋槳起落的無人機在工程作業時,要經過大量的空氣動力學計算,這些模擬測試都要在實驗室完成,包括機翼形狀、模型選用、氣流狀態等等,這些在真實環境難以還原的場景在計算機上就很容易實現。

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