“3小時可檢測出包括SARS、COVID-19等在內的所有人類已知基因組的病毒。”解放日報•上觀新聞記者從上海科技創新資源數據中心獲悉,,由該中心聯合中國科學院上海巴斯德研究所、中國科學院上海營養與健康研究所共同研發的基于二代測序數據的病毒基因組鑒定服務,從2月13日起通過上海科技創新資源數據中心官微,在線面向全國醫療機構、醫生和醫學研究者,免費開放至疫情全面結束。
基因組測序是新型冠狀病毒疑似病例確診的病原學證據之一,國家衛健委對《新型冠狀病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)》解讀時,特別針對鑒別診斷提到:“單從臨床表現、胸部影像學難以鑒別,需依靠病原學檢測來區分。”在當下疫情防控的攻堅階段,精準的基因組測序對每一位病患及奮戰在抗疫一線的醫務工作者來說,都是有效、及時進行診療的重要依據。
上海科技創新資源數據中心戰略部科學數據產品經理左天宇介紹,此次免費開放的病毒基因組鑒定將根據病患的呼吸道樣本二代測序數據,通過分析流程將樣本數據與病毒基因庫進行快速比對,虛擬主機,3小時便可檢測出包括SARS、COVID-19等在內的所有人類已知基因組的病毒。
病毒基因組鑒定與核酸檢查相比,VPS,優勢在于:不僅可精準識別病毒基因特性,還能監測病毒變異趨勢并及時做出更新判定。這與核酸檢查還是有本質區別的,形象來說,病毒核酸檢查做的是判斷題,而病毒基因組鑒定做的是簡答題。
上海科技創新資源數據中心CTO張嘉銳表示:“希望病毒基因組鑒定所形成的鑒定分析結果,能為更多的醫院、醫生進行臨床診斷和治療提供參考,為全面分析研究病患的呼吸道病毒組、研究其致病因子提供支撐,同時為疫情防控、疾病診治、藥物篩選、疫苗設計與藥物研發和對病毒朔源、變異進化、致病機理等研究工作提供支撐。”